Genomic Library vs. cDNA Library

ผู้เขียน: Laura McKinney
วันที่สร้าง: 6 เมษายน 2021
วันที่อัปเดต: 11 พฤษภาคม 2024
Anonim
cDNA library vs Genomic DNA library
วิดีโอ: cDNA library vs Genomic DNA library

เนื้อหา

Genomic library และ cDNA library ทั้งสองถูกใช้ในการโคลนยีนเพื่อแยก DNAs ที่แตกต่างกัน ความแตกต่างระหว่างห้องสมุดทั้งสองนี้คือห้องสมุดจีโนมประกอบด้วยชิ้นส่วนดีเอ็นเอซึ่งแสดงจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตในขณะที่ในห้องสมุด cDNA, mRNA นำมาจากเซลล์เฉพาะของสิ่งมีชีวิตและ cDNA ประกอบด้วย mRNA นี้ในปฏิกิริยาที่เร่งปฏิกิริยา โดยเอนไซม์


สารบัญ: ความแตกต่างระหว่าง Genomic Library และ cDNA Library

  • แผนภูมิเปรียบเทียบ
  • Genomic Library คืออะไร
  • cDNA Library คืออะไร
  • ความแตกต่างที่สำคัญ

แผนภูมิเปรียบเทียบ

รากฐานห้องสมุดจีโนมcDNA Library
คำนิยามห้องสมุดจีโนมคือชุดดีเอ็นเอจีโนมที่สมบูรณ์จากสิ่งมีชีวิตหนึ่งชนิด DNA ถูกเก็บไว้ในประชากรของเวกเตอร์ที่คล้ายกันโดยแต่ละอันจะมีส่วนแทรกที่แตกต่างกันของ DNAไลบรารี cDNA เป็นการผสมผสานกันของชิ้นส่วน cDNA ที่ถูกโคลนเข้าไปในเซลล์โฮสต์ที่คัดสรรแล้วซึ่งทำให้บางส่วนของ transcriptome ของสิ่งมีชีวิตรวมกัน
การแสดงออกจีโนมทั้งหมดยีนที่เฉพาะเจาะจงเท่านั้น
ขนาดที่ใหญ่กว่าที่มีขนาดเล็ก
intronsปัจจุบันขาด
เวกเตอร์มันใช้พลาสมิด, คอสมิด, แลมบ์ดาฟาจ, YAC และ BAC สำหรับที่พักของชิ้นส่วนขนาดใหญ่ไม่มีอินตรอนดังนั้นใช้พลาสมิด, phagemids, แลมบ์ดาฟาจเพื่อรองรับเศษเล็ก ๆ น้อย ๆ

Genomic Library คืออะไร

ในขั้นตอนการโคลนยีนยีนที่น่าสนใจจะถูกคัดลอกจาก DNA ที่แยกออกจากสิ่งมีชีวิต เมื่อ DNA ถูกแยกออกจากสิ่งมีชีวิตยีนของมันจะถูกสกัดออกมาในคราวเดียว DNA ของสิ่งมีชีวิตประกอบด้วยยีนต่าง ๆ นับพัน วิศวกรพันธุศาสตร์ค้นหายีนเฉพาะที่เข้ารหัสโปรตีนเฉพาะที่น่าสนใจ


ไม่มีวิธีการใดที่จะมียีนเฉพาะจาก DNA ได้ดังนั้นนักวิทยาศาสตร์จึงสร้างห้องสมุดยีนเพื่อทำแคตตาล็อก DNA ของสิ่งมีชีวิต นักวิทยาศาสตร์แล้วเลือกยีนที่ต้องการในห้องสมุด ห้องสมุดยีนเป็นกลุ่มของแบคทีเรียที่มีชีวิตซึ่งได้รับการแปลงร่างด้วยดีเอ็นเอที่เป็นเอกลักษณ์ในสิ่งมีชีวิตที่เป็นต้นกำเนิดของยีนที่ต้องการ DNA ถูกดึงออกมาจากสิ่งมีชีวิตเพื่อสร้างห้องสมุดที่มีรูปแบบเป็นระเบียบ Genomic library และ cDNA เป็นห้องสมุดยีนสองชนิด เทคนิคการโคลนยีนจำนวนมากถูกใช้เป็นกลยุทธ์ของยีนในเทคโนโลยีรีคอมบิแนนท์

ชิ้นส่วนดีเอ็นเอจะถูกแยกออกโดยการตัดด้วยเอนไซม์ จำกัด เฉพาะจาก DNA แม่ ชิ้นส่วนเหล่านี้จะถูกยึดเป็นโมเลกุลเวกเตอร์และโมเลกุลที่สะสมจะถูกย้ายไปยังเซลล์เจ้าบ้าน 1 โมเลกุลในทุกเซลล์ ห้องสมุดจีโนมประกอบด้วยอินตรอนดีเอ็นเอขยะและชิ้นส่วนอื่น ๆ จำนวนมาก ภายในห้องสมุดนี้ DNA ถูกแบ่งออกเป็นชิ้นส่วนเล็ก ๆ ภายในเซลล์ ต่อไปนี้ส่วนเล็ก ๆ ทั้งหมดจะถูกแทรกเข้าไปในเวกเตอร์เพื่อสร้างห้องสมุด ห้องสมุดจีโนมประกอบด้วย DNA ทั้งหมดของยีนทั้งหมดและเซลล์ประกอบด้วยอินตรอนทั้งหมด จีโนมดีเอ็นเอเป็นการแปลจีโนมทั้งหมด มันไม่ได้เข้ารหัสส่วนทั้งหมดใน codon เดียวเนื่องจากขนาดของอินตรอน ไม่มีกลไกการต่อรอยที่ห้องสมุดจีโนมที่ทำให้เกิดปัญหาในการแสดงออกของยีนที่นำมาจากห้องสมุดนี้


cDNA Library คืออะไร

ไลบรารี cDNA ถูกสร้างขึ้นโดยเลือกหนึ่งเนื้อเยื่อหรือเซลล์ชนิดหนึ่ง mRNA ต่อมาถูกแยกออกจากเนื้อเยื่อหรือเซลล์นั้น สำเนา DNA ของโมเลกุล mRNA ประกอบไปด้วยเอนไซม์เฉพาะเอนไซม์ transcriptase reverse ดังนั้นห้องสมุด cDNA จึงมี DNA เฉพาะที่มีอยู่ใน mRNA ไม่พบอินตรอนและไม่พบลำดับดีเอ็นเอในไลบรารีนี้ ภายในห้องสมุดนี้โคลนทั้งหมดมีความยาวเต็ม นอกจากนี้ cDNA clone ยังเป็นสิ่งจำเป็นในการสร้างเซลล์สำหรับการผลิตโปรตีนหรือการตรวจด้วยเซลล์

ความแตกต่างที่สำคัญ

  1. ห้องสมุดจีโนมเขียนโดยตรงจากจีโนมดีเอ็นเอ
  2. cDNA Library ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ mRNA เป็นเทมเพลต
  3. ห้องสมุดจีโนมใช้จีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตนี้
  4. ไลบรารี cDNA แสดงเฉพาะยีนของโรคเฉพาะ
  5. เอ็นไซม์สองชนิด, เอ็นโดนิเดสที่ จำกัด และลิแกนส์มีความสำคัญสำหรับการสร้างห้องสมุดจีโนม
  6. เอนไซม์ transcriptase ย้อนกลับมีบทบาทสำคัญในการสร้างห้องสมุด cDNA
  7. ห้องสมุดจีโนมใช้ DNA ของสิ่งมีชีวิตทั้งโปรคาริโอตและยูคาริโอต
  8. cDNA library แสดงถึง DNA ของสิ่งมีชีวิตยูคาริโอต
  9. cDNA library มีความสามารถในการแสดงออกของจีโนมในแบคทีเรียที่เป็นโปรคาริโอตเนื่องจากไม่มีอินตรอน
  10. ห้องสมุดจีโนมไม่สามารถพูดได้ในสิ่งมีชีวิตแบบโปรคาริโอตเนื่องจากมีอินตรอนและสิ่งมีชีวิตแบบโปรคาริโอตไม่มีเครื่องมือใด ๆ ในการประมวลผลแบบอินตรอน