Genomic Library vs. cDNA Library
เนื้อหา
- สารบัญ: ความแตกต่างระหว่าง Genomic Library และ cDNA Library
- แผนภูมิเปรียบเทียบ
- Genomic Library คืออะไร
- cDNA Library คืออะไร
- ความแตกต่างที่สำคัญ
Genomic library และ cDNA library ทั้งสองถูกใช้ในการโคลนยีนเพื่อแยก DNAs ที่แตกต่างกัน ความแตกต่างระหว่างห้องสมุดทั้งสองนี้คือห้องสมุดจีโนมประกอบด้วยชิ้นส่วนดีเอ็นเอซึ่งแสดงจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตในขณะที่ในห้องสมุด cDNA, mRNA นำมาจากเซลล์เฉพาะของสิ่งมีชีวิตและ cDNA ประกอบด้วย mRNA นี้ในปฏิกิริยาที่เร่งปฏิกิริยา โดยเอนไซม์
สารบัญ: ความแตกต่างระหว่าง Genomic Library และ cDNA Library
- แผนภูมิเปรียบเทียบ
- Genomic Library คืออะไร
- cDNA Library คืออะไร
- ความแตกต่างที่สำคัญ
แผนภูมิเปรียบเทียบ
รากฐาน | ห้องสมุดจีโนม | cDNA Library |
คำนิยาม | ห้องสมุดจีโนมคือชุดดีเอ็นเอจีโนมที่สมบูรณ์จากสิ่งมีชีวิตหนึ่งชนิด DNA ถูกเก็บไว้ในประชากรของเวกเตอร์ที่คล้ายกันโดยแต่ละอันจะมีส่วนแทรกที่แตกต่างกันของ DNA | ไลบรารี cDNA เป็นการผสมผสานกันของชิ้นส่วน cDNA ที่ถูกโคลนเข้าไปในเซลล์โฮสต์ที่คัดสรรแล้วซึ่งทำให้บางส่วนของ transcriptome ของสิ่งมีชีวิตรวมกัน |
การแสดงออก | จีโนมทั้งหมด | ยีนที่เฉพาะเจาะจงเท่านั้น |
ขนาด | ที่ใหญ่กว่า | ที่มีขนาดเล็ก |
introns | ปัจจุบัน | ขาด |
เวกเตอร์ | มันใช้พลาสมิด, คอสมิด, แลมบ์ดาฟาจ, YAC และ BAC สำหรับที่พักของชิ้นส่วนขนาดใหญ่ | ไม่มีอินตรอนดังนั้นใช้พลาสมิด, phagemids, แลมบ์ดาฟาจเพื่อรองรับเศษเล็ก ๆ น้อย ๆ |
Genomic Library คืออะไร
ในขั้นตอนการโคลนยีนยีนที่น่าสนใจจะถูกคัดลอกจาก DNA ที่แยกออกจากสิ่งมีชีวิต เมื่อ DNA ถูกแยกออกจากสิ่งมีชีวิตยีนของมันจะถูกสกัดออกมาในคราวเดียว DNA ของสิ่งมีชีวิตประกอบด้วยยีนต่าง ๆ นับพัน วิศวกรพันธุศาสตร์ค้นหายีนเฉพาะที่เข้ารหัสโปรตีนเฉพาะที่น่าสนใจ
ไม่มีวิธีการใดที่จะมียีนเฉพาะจาก DNA ได้ดังนั้นนักวิทยาศาสตร์จึงสร้างห้องสมุดยีนเพื่อทำแคตตาล็อก DNA ของสิ่งมีชีวิต นักวิทยาศาสตร์แล้วเลือกยีนที่ต้องการในห้องสมุด ห้องสมุดยีนเป็นกลุ่มของแบคทีเรียที่มีชีวิตซึ่งได้รับการแปลงร่างด้วยดีเอ็นเอที่เป็นเอกลักษณ์ในสิ่งมีชีวิตที่เป็นต้นกำเนิดของยีนที่ต้องการ DNA ถูกดึงออกมาจากสิ่งมีชีวิตเพื่อสร้างห้องสมุดที่มีรูปแบบเป็นระเบียบ Genomic library และ cDNA เป็นห้องสมุดยีนสองชนิด เทคนิคการโคลนยีนจำนวนมากถูกใช้เป็นกลยุทธ์ของยีนในเทคโนโลยีรีคอมบิแนนท์
ชิ้นส่วนดีเอ็นเอจะถูกแยกออกโดยการตัดด้วยเอนไซม์ จำกัด เฉพาะจาก DNA แม่ ชิ้นส่วนเหล่านี้จะถูกยึดเป็นโมเลกุลเวกเตอร์และโมเลกุลที่สะสมจะถูกย้ายไปยังเซลล์เจ้าบ้าน 1 โมเลกุลในทุกเซลล์ ห้องสมุดจีโนมประกอบด้วยอินตรอนดีเอ็นเอขยะและชิ้นส่วนอื่น ๆ จำนวนมาก ภายในห้องสมุดนี้ DNA ถูกแบ่งออกเป็นชิ้นส่วนเล็ก ๆ ภายในเซลล์ ต่อไปนี้ส่วนเล็ก ๆ ทั้งหมดจะถูกแทรกเข้าไปในเวกเตอร์เพื่อสร้างห้องสมุด ห้องสมุดจีโนมประกอบด้วย DNA ทั้งหมดของยีนทั้งหมดและเซลล์ประกอบด้วยอินตรอนทั้งหมด จีโนมดีเอ็นเอเป็นการแปลจีโนมทั้งหมด มันไม่ได้เข้ารหัสส่วนทั้งหมดใน codon เดียวเนื่องจากขนาดของอินตรอน ไม่มีกลไกการต่อรอยที่ห้องสมุดจีโนมที่ทำให้เกิดปัญหาในการแสดงออกของยีนที่นำมาจากห้องสมุดนี้
cDNA Library คืออะไร
ไลบรารี cDNA ถูกสร้างขึ้นโดยเลือกหนึ่งเนื้อเยื่อหรือเซลล์ชนิดหนึ่ง mRNA ต่อมาถูกแยกออกจากเนื้อเยื่อหรือเซลล์นั้น สำเนา DNA ของโมเลกุล mRNA ประกอบไปด้วยเอนไซม์เฉพาะเอนไซม์ transcriptase reverse ดังนั้นห้องสมุด cDNA จึงมี DNA เฉพาะที่มีอยู่ใน mRNA ไม่พบอินตรอนและไม่พบลำดับดีเอ็นเอในไลบรารีนี้ ภายในห้องสมุดนี้โคลนทั้งหมดมีความยาวเต็ม นอกจากนี้ cDNA clone ยังเป็นสิ่งจำเป็นในการสร้างเซลล์สำหรับการผลิตโปรตีนหรือการตรวจด้วยเซลล์
ความแตกต่างที่สำคัญ
- ห้องสมุดจีโนมเขียนโดยตรงจากจีโนมดีเอ็นเอ
- cDNA Library ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ mRNA เป็นเทมเพลต
- ห้องสมุดจีโนมใช้จีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตนี้
- ไลบรารี cDNA แสดงเฉพาะยีนของโรคเฉพาะ
- เอ็นไซม์สองชนิด, เอ็นโดนิเดสที่ จำกัด และลิแกนส์มีความสำคัญสำหรับการสร้างห้องสมุดจีโนม
- เอนไซม์ transcriptase ย้อนกลับมีบทบาทสำคัญในการสร้างห้องสมุด cDNA
- ห้องสมุดจีโนมใช้ DNA ของสิ่งมีชีวิตทั้งโปรคาริโอตและยูคาริโอต
- cDNA library แสดงถึง DNA ของสิ่งมีชีวิตยูคาริโอต
- cDNA library มีความสามารถในการแสดงออกของจีโนมในแบคทีเรียที่เป็นโปรคาริโอตเนื่องจากไม่มีอินตรอน
- ห้องสมุดจีโนมไม่สามารถพูดได้ในสิ่งมีชีวิตแบบโปรคาริโอตเนื่องจากมีอินตรอนและสิ่งมีชีวิตแบบโปรคาริโอตไม่มีเครื่องมือใด ๆ ในการประมวลผลแบบอินตรอน